Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Crygs-201ENSMUST00000040592 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
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Pkp4Q68FH0 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Nexmif-202ENSMUST00000087879 10891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Emilin1-201ENSMUST00000031055 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-206ENSMUST00000105944 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pkp4Q68FH0 Tnnt3-210ENSMUST00000105948 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
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