Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Pigk-201ENSMUST00000045029 1761 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm11422-201ENSMUST00000118925 1103 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 A930005H10Rik-204ENSMUST00000185681 625 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 A930005H10Rik-206ENSMUST00000188260 739 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 BC024139-202ENSMUST00000089654 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gsdmcl2-203ENSMUST00000185431 1911 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Zfp689-201ENSMUST00000053392 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Rbm3os-201ENSMUST00000124018 839 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 BB557941-201ENSMUST00000126549 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
Znf280dQ68FE8 Lta-201ENSMUST00000025266 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Sp2-202ENSMUST00000107623 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Prx-204ENSMUST00000125990 4298 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm18460-201ENSMUST00000208088 464 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Znf280dQ68FE8 Gm7972-202ENSMUST00000208453 505 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms