Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Dlg4-203ENSMUST00000108588 3457 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Pabpc1-201ENSMUST00000001809 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rgs6-211ENSMUST00000191107 1621 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc2a7-201ENSMUST00000059893 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-205ENSMUST00000108608 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm14585-201ENSMUST00000120713 634 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Nrg4-204ENSMUST00000130158 1000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Ctnna3Q65CL1 Slc35b3-202ENSMUST00000167513 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gdap2-202ENSMUST00000106997 2014 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ctnna3Q65CL1 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ctnna3Q65CL1 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Ctnna3Q65CL1 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm34809-203ENSMUST00000222945 509 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Trpv4-205ENSMUST00000112225 3226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 AC166359.1-201ENSMUST00000220243 1871 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Ctnna3Q65CL1 Hnrnph2-203ENSMUST00000074950 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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