Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 AC115304.2-201ENSMUST00000226399 332 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Cenpn-203ENSMUST00000212263 1616 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Syk-202ENSMUST00000118756 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Faah-201ENSMUST00000049095 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pigo-201ENSMUST00000067481 3525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Acnat2-202ENSMUST00000107698 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Nxf2-202ENSMUST00000113187 2316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 4932431P20Rik-201ENSMUST00000098602 1340 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 4930558J22Rik-201ENSMUST00000139822 1480 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
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PtprdQ64487 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
PtprdQ64487 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Nnt-201ENSMUST00000069902 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PtprdQ64487 Gsto1-201ENSMUST00000026050 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PtprdQ64487 Uimc1-201ENSMUST00000026997 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
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PtprdQ64487 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Camk4-201ENSMUST00000042868 12331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Galnt11-202ENSMUST00000114950 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Drc7-201ENSMUST00000058479 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PtprdQ64487 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
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