Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 AC170597.1-201ENSMUST00000221956 440 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm5449-201ENSMUST00000081132 357 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Vsx1-201ENSMUST00000046095 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Dcaf12-201ENSMUST00000030145 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Fas-202ENSMUST00000112472 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Sall3Q62255 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Bloc1s1-201ENSMUST00000026405 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Ctrl-201ENSMUST00000034368 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 P2rx7-202ENSMUST00000086247 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sall3Q62255 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sall3Q62255 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sall3Q62255 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sall3Q62255 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sall3Q62255 Triml2-201ENSMUST00000163869 1467 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Cbx7-202ENSMUST00000109615 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm13802-201ENSMUST00000150159 663 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm17115-201ENSMUST00000164075 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Sall3Q62255 Gm34312-201ENSMUST00000204650 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 CT025531.1-201ENSMUST00000214534 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Sox7-201ENSMUST00000079652 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 1700057H21Rik-202ENSMUST00000154530 506 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sall3Q62255 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms