Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ5

Tns3, Tensin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tns3Q5SSZ5 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm14639-201ENSMUST00000120850 866 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm12853-201ENSMUST00000134971 442 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 AC133496.1-201ENSMUST00000223891 743 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Cep70-207ENSMUST00000190715 1768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Eif4enif1-213ENSMUST00000179770 3676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm33831-201ENSMUST00000211696 1542 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 1700064H15Rik-201ENSMUST00000119133 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Eif5a-212ENSMUST00000153652 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Mir124-2hg-203ENSMUST00000186923 673 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm18552-201ENSMUST00000187425 538 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm36307-201ENSMUST00000195831 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm42687-201ENSMUST00000199075 164 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Sult2b1-207ENSMUST00000210754 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 AC163638.2-201ENSMUST00000224920 827 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 AC102523.1-201ENSMUST00000228706 1144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Fthl17a-201ENSMUST00000048382 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Klk1b26-201ENSMUST00000048945 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tns3Q5SSZ5 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Zfand1-202ENSMUST00000108377 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Rrm2b-207ENSMUST00000146821 420 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm26943-201ENSMUST00000182295 957 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm6370-202ENSMUST00000198912 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm44917-201ENSMUST00000208798 520 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm18256-201ENSMUST00000209087 907 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm18164-201ENSMUST00000213769 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm18166-201ENSMUST00000215557 927 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Nqo2-203ENSMUST00000220844 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Lcn3-201ENSMUST00000028304 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm22341-201ENSMUST00000083775 129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Mir341-201ENSMUST00000093593 96 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Epha6-203ENSMUST00000161358 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Ccdc42-202ENSMUST00000102612 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tns3Q5SSZ5 Ywhaq-ps3-201ENSMUST00000120944 738 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms