Protein–RNA interactions for Protein: Q571B6

Whamm, WASP homolog-associated protein with actin, membranes and microtubules, mousemouse

Predictions only

Length 793 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WhammQ571B6 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Retn-202ENSMUST00000169234 1139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Mir124a-1hg-201ENSMUST00000180610 4103 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Slc25a12-206ENSMUST00000151937 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tldc1-201ENSMUST00000049156 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gpatch2-204ENSMUST00000110943 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Adar-204ENSMUST00000118341 2399 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Anks1b-216ENSMUST00000182430 3305 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Psma1-203ENSMUST00000135570 960 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Arhgef2-231ENSMUST00000177498 3966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Map4-204ENSMUST00000164930 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Myo18a-208ENSMUST00000108375 7513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm38100-202ENSMUST00000201297 1789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 G630064G18Rik-201ENSMUST00000209814 1795 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Rbfox2-203ENSMUST00000166610 6573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Slc6a9-202ENSMUST00000063857 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Cyp26b1-205ENSMUST00000205228 4288 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Acox3-203ENSMUST00000114237 2956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Gm42602-201ENSMUST00000200288 3224 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
WhammQ571B6 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms