Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9034-201ENSMUST00000182071 1005 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm17029-203ENSMUST00000153443 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Plekhg4-206ENSMUST00000214056 3654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Dglucy-204ENSMUST00000110073 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpm6b-209ENSMUST00000112235 4480 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 C130060K24Rik-203ENSMUST00000170608 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Inpp4a-202ENSMUST00000058307 2963 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C10Rik-202ENSMUST00000165308 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 1600014C10Rik-204ENSMUST00000178207 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Sirpa-204ENSMUST00000103203 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Scrn1-201ENSMUST00000019268 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Prpf40b-202ENSMUST00000118287 3129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Abi1-206ENSMUST00000126112 3360 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-M6-ps-201ENSMUST00000119193 1034 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
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D13Ertd608eQ3UPR8 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 P2ry1-202ENSMUST00000193201 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Trim36-202ENSMUST00000167364 4543 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Syt11-203ENSMUST00000107505 5020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Pip5k1b-201ENSMUST00000025800 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Gal3st4-201ENSMUST00000100530 3162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc79-202ENSMUST00000101099 8874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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