Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Asb7-202ENSMUST00000124899 4928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Sept9-202ENSMUST00000093907 3616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Phf21a-209ENSMUST00000111297 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Phf21a-201ENSMUST00000044036 6187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Spata24-201ENSMUST00000025209 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Spata24-202ENSMUST00000096573 709 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Trafd1Q3UDK1 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms