Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTP0

Shcbp1l, Testicular spindle-associated protein SHCBP1L, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1lQ3TTP0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45902-202ENSMUST00000140494 2390 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm2128-201ENSMUST00000108009 2560 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Abcd3-201ENSMUST00000029770 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rad51c-201ENSMUST00000007790 1632 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Atp8a2-202ENSMUST00000131670 1725 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Padi6-201ENSMUST00000038749 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Snx29-202ENSMUST00000115814 1125 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm22138-201ENSMUST00000158748 128 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fgf5-202ENSMUST00000200059 600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm45219-201ENSMUST00000205602 465 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Shcbp1lQ3TTP0 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
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Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Abat-201ENSMUST00000065987 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Cd163l1-201ENSMUST00000084460 3454 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Zfp639-201ENSMUST00000029203 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11451-201ENSMUST00000118946 630 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Shcbp1lQ3TTP0 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
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