Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Scn10a-202ENSMUST00000213392 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmub2-201ENSMUST00000036376 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm38151-201ENSMUST00000195085 289 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Scaf1-206ENSMUST00000211735 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Trappc13Q3TIR1 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
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