Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm44913-201ENSMUST00000208060 2990 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Trpv6-203ENSMUST00000201471 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Samd5-201ENSMUST00000100070 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Styxl1-203ENSMUST00000111162 726 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pfdn5-203ENSMUST00000165671 830 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8756-201ENSMUST00000183250 929 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Mir6953-201ENSMUST00000184745 68 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm35960-201ENSMUST00000202712 767 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm45481-201ENSMUST00000209717 877 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm5907-202ENSMUST00000210969 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gm8255-201ENSMUST00000218693 305 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Eef1akmt1-201ENSMUST00000022518 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 AC102847.1-202ENSMUST00000226313 1245 ntBASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Gapdhs-203ENSMUST00000182634 1457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Samd11Q1RNF8 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mylk-201ENSMUST00000023538 7824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Poc1a-209ENSMUST00000216228 1431 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lrp2bp-201ENSMUST00000066451 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Tmem91-203ENSMUST00000108405 550 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lemd1-201ENSMUST00000112357 964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Apoc3-202ENSMUST00000118649 453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11993-201ENSMUST00000121861 820 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Myl3-202ENSMUST00000124267 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm15506-201ENSMUST00000148776 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm11269-201ENSMUST00000157011 595 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm25492-201ENSMUST00000157383 129 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm7627-201ENSMUST00000183205 999 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm8384-201ENSMUST00000190905 704 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm37197-201ENSMUST00000195607 401 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Chn2-210ENSMUST00000203091 755 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm4903-201ENSMUST00000210462 405 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm9796-201ENSMUST00000062249 2250 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Creb3l4-201ENSMUST00000029547 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Pik3r1-201ENSMUST00000035532 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Grsf1-202ENSMUST00000113234 2286 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Samd11Q1RNF8 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms