Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Akr1b10-202ENSMUST00000115051 1022 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13091-201ENSMUST00000128800 469 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm25072-201ENSMUST00000175233 235 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 4930453L07Rik-201ENSMUST00000209053 1439 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cib2-201ENSMUST00000041901 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Dnajb6-201ENSMUST00000008733 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Snap29-201ENSMUST00000023449 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mxd3-201ENSMUST00000021941 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fn3krp-201ENSMUST00000038096 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Acad8-201ENSMUST00000060513 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Selenot-ps-201ENSMUST00000119098 593 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Spdye4a-202ENSMUST00000160502 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fam160b2-201ENSMUST00000022690 4033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15985-201ENSMUST00000137731 343 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Trim71Q1PSW8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
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