Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm3836-201ENSMUST00000211377 1613 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Oplah-209ENSMUST00000171340 4085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm42498-201ENSMUST00000199981 1372 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Arhgef9-206ENSMUST00000113884 3784 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm29609-201ENSMUST00000101411 3223 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Lox-201ENSMUST00000025409 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Sparc-201ENSMUST00000018737 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gcn1l1-201ENSMUST00000064454 8555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Aldh3a1-202ENSMUST00000108716 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm13888-201ENSMUST00000119148 422 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm23045-201ENSMUST00000175041 96 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cdrt4os1-201ENSMUST00000130177 2090 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
VgfQ0VGU4 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.7 ms