Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Scn5a-203ENSMUST00000120420 7536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tnni2-206ENSMUST00000149529 768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 9430093N23Rik-201ENSMUST00000152494 515 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm28982-201ENSMUST00000186895 512 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm43002-201ENSMUST00000200310 155 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ankrd7-201ENSMUST00000031489 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ubl5-201ENSMUST00000129414 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Carns1-201ENSMUST00000167055 3968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Stard4-201ENSMUST00000025236 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Madd-202ENSMUST00000066473 5974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Apc-203ENSMUST00000115781 12346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 F10-205ENSMUST00000152034 1449 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Zfp217-202ENSMUST00000109155 5670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Amotl1-201ENSMUST00000013220 8957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Wsb2-ps-201ENSMUST00000117937 1217 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
StumQ0VBF8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.67□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms