Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL02

Trio, Triple functional domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 3,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrioQ0KL02 Tmem212-201ENSMUST00000058077 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fdps-201ENSMUST00000081848 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm14997-201ENSMUST00000119232 636 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Treml4-203ENSMUST00000136272 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 2210408F21Rik-209ENSMUST00000146778 579 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Treml4-206ENSMUST00000154335 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Atp5e-201ENSMUST00000016396 421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm19014-201ENSMUST00000184828 1189 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Crip1-206ENSMUST00000200553 516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm45808-201ENSMUST00000210701 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm5194-201ENSMUST00000221457 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC159196.1-201ENSMUST00000225524 377 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Cnppd1-202ENSMUST00000168720 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ighv13-1-201ENSMUST00000103480 294 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm13777-201ENSMUST00000118208 345 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm15132-201ENSMUST00000118581 652 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm33969-201ENSMUST00000197615 388 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC102327.1-201ENSMUST00000226389 742 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Fam60a-201ENSMUST00000054080 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Colec11-201ENSMUST00000036136 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Edn1-201ENSMUST00000021796 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Hk1-202ENSMUST00000099691 4278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Amd-ps3-201ENSMUST00000072796 1496 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Galntl5-201ENSMUST00000030778 1627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rpl7a-ps11-201ENSMUST00000118791 801 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm40689-201ENSMUST00000218006 362 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC140314.1-201ENSMUST00000219549 554 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 AC153153.1-201ENSMUST00000225803 793 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm16477-201ENSMUST00000085365 801 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm17415-201ENSMUST00000096427 789 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Slc25a14-208ENSMUST00000177710 1516 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Ms4a7-203ENSMUST00000067532 1334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dab2ip-209ENSMUST00000135741 4128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nanog-201ENSMUST00000012540 2211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm12240-201ENSMUST00000120178 229 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm15489-201ENSMUST00000132811 973 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 2410124H12Rik-201ENSMUST00000160494 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Gm9409-201ENSMUST00000197017 316 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Dph5-202ENSMUST00000106505 1836 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 4930593A02Rik-201ENSMUST00000181694 1437 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
TrioQ0KL02 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms