Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm16560-201ENSMUST00000159115 404 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm22616-201ENSMUST00000179783 100 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm34397-201ENSMUST00000213192 708 ntTSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm25514-201ENSMUST00000083860 135 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm45124-201ENSMUST00000206723 2755 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hnrnpa2b1-203ENSMUST00000114459 1728 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cog3-203ENSMUST00000227473 4197 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Banf2os-201ENSMUST00000124061 771 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm15339-201ENSMUST00000153577 506 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5845-201ENSMUST00000195812 796 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm42980-201ENSMUST00000200582 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Iyd-201ENSMUST00000019896 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hat1-201ENSMUST00000028408 1576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm2244-201ENSMUST00000164372 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Plac9b-201ENSMUST00000100809 388 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Ighv8-11-201ENSMUST00000103536 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Rgs8-205ENSMUST00000111815 765 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Snrnp27-201ENSMUST00000001186 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prelid3b-203ENSMUST00000120822 622 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm6881-201ENSMUST00000121811 833 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Cyp2j15-ps-201ENSMUST00000122267 686 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm3233-201ENSMUST00000168997 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Fam47e-205ENSMUST00000175974 1016 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm5259-201ENSMUST00000191231 800 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm37872-201ENSMUST00000192362 886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm42821-201ENSMUST00000199771 489 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prss23os-203ENSMUST00000208814 975 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Prss23os-204ENSMUST00000209064 972 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Dmtf1-201ENSMUST00000071921 3806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ubxn2bQ0KL01 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms