Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ttc21bQ0HA38 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mip-201ENSMUST00000026455 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Tpi1-203ENSMUST00000149610 802 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Gm24312-201ENSMUST00000178677 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 n-R5s106-201ENSMUST00000179060 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 n-R5s118-201ENSMUST00000179887 119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm7238-201ENSMUST00000206467 973 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm13539-202ENSMUST00000211245 552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cypt12-201ENSMUST00000029080 550 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Olfr700-201ENSMUST00000079936 951 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm6478-201ENSMUST00000099450 742 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC113282.5-201ENSMUST00000224330 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Triml2-202ENSMUST00000209200 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Gm23769-201ENSMUST00000104441 121 ntBASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Plce1-204ENSMUST00000182481 8357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Nifk-202ENSMUST00000112688 849 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 7420461P10Rik-201ENSMUST00000169439 781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Myo1h-206ENSMUST00000196467 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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Ttc21bQ0HA38 Nkain2-205ENSMUST00000219125 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 AC121567.1-201ENSMUST00000227213 842 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Cenpx-201ENSMUST00000026137 692 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Nkg7-201ENSMUST00000070518 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ttc21bQ0HA38 Dcpp2-201ENSMUST00000088598 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
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