Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Zfp872-201ENSMUST00000091508 1395 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm44106-201ENSMUST00000203153 1599 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gfi1b-201ENSMUST00000028156 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Msi2-203ENSMUST00000107909 6436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ighv1-5-201ENSMUST00000103494 294 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 C030013C21Rik-201ENSMUST00000133400 795 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm14798-201ENSMUST00000139695 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm13133-201ENSMUST00000143888 736 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 1110020A21Rik-201ENSMUST00000181147 853 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm38007-201ENSMUST00000192187 313 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm43244-201ENSMUST00000196994 1285 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Fbp2-201ENSMUST00000021907 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Pycr1-206ENSMUST00000170556 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ppp6r3-202ENSMUST00000113997 4952 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Fam45a-202ENSMUST00000119633 2267 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Itpa-ps1-201ENSMUST00000117207 597 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm1826-201ENSMUST00000118646 1162 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Lrrc75aos2-202ENSMUST00000128647 1227 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm15540-201ENSMUST00000136052 674 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 St8sia3os-204ENSMUST00000140903 383 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm4982-201ENSMUST00000160440 1098 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Abhd4-208ENSMUST00000199338 868 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm30055-201ENSMUST00000203175 803 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Gm6518-201ENSMUST00000208450 342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Tpi-rs4-201ENSMUST00000213734 720 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Olfr63-201ENSMUST00000067840 955 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Olfr525-201ENSMUST00000078103 1050 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Tdpoz3-201ENSMUST00000081780 1098 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 2310016G11Rik-201ENSMUST00000094460 992 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ptpn2-202ENSMUST00000120934 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Clpx-201ENSMUST00000015501 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Sox9Q04887 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms