Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Prf1-202ENSMUST00000219375 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Chrne-201ENSMUST00000014753 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm26642-201ENSMUST00000180981 2782 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pknox1-206ENSMUST00000176701 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Jak3-202ENSMUST00000110012 3774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Serpina16-202ENSMUST00000164148 1582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Thbs2Q03350 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Thbs2Q03350 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Thbs2Q03350 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm38979-201ENSMUST00000207099 698 ntTSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm44651-201ENSMUST00000207343 372 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Thbs2Q03350 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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Thbs2Q03350 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 B3glct-201ENSMUST00000100404 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Scn8a-203ENSMUST00000108908 7030 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
Thbs2Q03350 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Thbs2Q03350 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms