Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Zc3h12a-201ENSMUST00000036188 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm10463-202ENSMUST00000195772 2889 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm42031-201ENSMUST00000209823 1885 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Lck-208ENSMUST00000167288 2074 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Immt-205ENSMUST00000166938 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
GscQ02591 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Robo4-203ENSMUST00000115048 3392 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ccdc127-205ENSMUST00000162672 677 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm34767-201ENSMUST00000191813 1062 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Arl8b-201ENSMUST00000032196 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Pax3-201ENSMUST00000004994 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
GscQ02591 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ces2h-201ENSMUST00000172032 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Tob2-201ENSMUST00000050467 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm10912-201ENSMUST00000104891 1661 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm15997-201ENSMUST00000202188 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm9962-202ENSMUST00000186595 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Ntrk3-206ENSMUST00000195262 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Nmb-202ENSMUST00000119428 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
GscQ02591 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms