Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Chd7-206ENSMUST00000170391 3462 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tex45-203ENSMUST00000161680 1526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Plekha5-201ENSMUST00000087622 7382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Nr1i2-201ENSMUST00000023504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm17077-201ENSMUST00000133179 279 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Kdm4dl-201ENSMUST00000184843 1187 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm29400-201ENSMUST00000187208 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm28662-201ENSMUST00000188446 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm28251-201ENSMUST00000188835 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm37318-201ENSMUST00000194325 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm38017-201ENSMUST00000194768 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm37287-201ENSMUST00000195449 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm37793-201ENSMUST00000195548 695 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Nanos3-202ENSMUST00000210202 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ankrd1-201ENSMUST00000025718 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Taf6-202ENSMUST00000110936 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Hoxd1Q01822 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Hoxd1Q01822 Lck-201ENSMUST00000067240 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
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Hoxd1Q01822 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm36940-201ENSMUST00000194281 2036 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Abhd14a-201ENSMUST00000048685 1256 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Hoxd1Q01822 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
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