Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

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Length 765 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Pabpc4-202ENSMUST00000080178 3019 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23aQ01405 Gm27232-201ENSMUST00000184373 597 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23aQ01405 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23aQ01405 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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Sec23aQ01405 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Sec23aQ01405 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sec23aQ01405 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sec23aQ01405 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Sec23aQ01405 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Sec23aQ01405 Prr3-206ENSMUST00000173585 770 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Sec23aQ01405 Eef1b2-209ENSMUST00000188524 681 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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