Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ighg2b-202ENSMUST00000192188 2566 ntAPPRIS P5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm11473-201ENSMUST00000118980 359 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm14176-201ENSMUST00000121302 477 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Pradc1-204ENSMUST00000126805 953 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Mok-204ENSMUST00000177224 551 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 1810026B05Rik-208ENSMUST00000190028 590 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm43997-201ENSMUST00000203986 1005 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm9619-201ENSMUST00000211587 762 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Zfp14-201ENSMUST00000077787 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Eloc-208ENSMUST00000188641 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm23132-201ENSMUST00000104254 132 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Junos-202ENSMUST00000125438 559 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm14004-201ENSMUST00000138875 590 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Tcl1-203ENSMUST00000175652 535 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm16755-201ENSMUST00000180595 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm27833-201ENSMUST00000184285 124 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 CT025679.1-201ENSMUST00000227106 449 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Grin2bQ01097 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ndufb5-202ENSMUST00000121778 574 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm45716-201ENSMUST00000124877 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm28415-201ENSMUST00000187528 452 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Cinp-201ENSMUST00000043716 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ppara-201ENSMUST00000057979 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Stx17-203ENSMUST00000107721 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm13192-201ENSMUST00000101199 208 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm12470-201ENSMUST00000117239 1049 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm10443-201ENSMUST00000119024 210 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm14148-201ENSMUST00000122433 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm20568-201ENSMUST00000197129 208 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gm45090-201ENSMUST00000208775 1148 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Gzmk-201ENSMUST00000038212 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 E330021D16Rik-201ENSMUST00000058713 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Axin2-201ENSMUST00000052915 4260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Rasgrp1-204ENSMUST00000173252 1750 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Grin2bQ01097 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 103.2 ms