Protein–RNA interactions for Protein: P70255

Nfic, Nuclear factor 1 C-type, mousemouse

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NficP70255 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Scpep1-201ENSMUST00000000287 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Ttc30b-201ENSMUST00000099996 2737 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm45575-201ENSMUST00000210283 548 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm18212-201ENSMUST00000211678 889 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 CT030182.1-201ENSMUST00000225935 533 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Slc44a1-204ENSMUST00000107647 2176 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Pafah2-201ENSMUST00000105869 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
NficP70255 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Gm37849-201ENSMUST00000194722 1881 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Vmn1r24-201ENSMUST00000228097 1901 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Kalrn-202ENSMUST00000089655 6506 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Ap1s2-203ENSMUST00000112294 3199 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
NficP70255 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Capn15-201ENSMUST00000041641 3520 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Sertm1-201ENSMUST00000070342 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Samd4b-201ENSMUST00000040531 4349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Scn9a-201ENSMUST00000100063 9813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Scn9a-202ENSMUST00000100064 9840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Gmps-201ENSMUST00000029405 8105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Fam198b-202ENSMUST00000118853 6729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
NficP70255 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
NficP70255 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms