Protein–RNA interactions for Protein: P70122

Sbds, Ribosome maturation protein SBDS, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbdsP70122 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Olfr61-201ENSMUST00000084455 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
SbdsP70122 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Klhl22-208ENSMUST00000165790 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Enam-201ENSMUST00000031222 5483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
SbdsP70122 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Golga2-203ENSMUST00000113377 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fbln2-202ENSMUST00000113498 4644 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Adgre5-203ENSMUST00000109802 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Add2-207ENSMUST00000203724 3143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Olfr46-203ENSMUST00000214180 7750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Fibcd1-201ENSMUST00000028188 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
SbdsP70122 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms