Protein–RNA interactions for Protein: P62996

Tra2b, Transformer-2 protein homolog beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tra2bP62996 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ascc2-202ENSMUST00000109930 4844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Nr2c1-202ENSMUST00000099343 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Trpc6-201ENSMUST00000050433 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Fam227a-202ENSMUST00000109646 1896 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Tra2bP62996 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms