Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Snrk-203ENSMUST00000120173 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ank2-221ENSMUST00000182994 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rps18-ps3-201ENSMUST00000080443 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rin2-202ENSMUST00000110005 4641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Nfasc-203ENSMUST00000163770 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Cyp11b1-201ENSMUST00000170259 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Epha5-206ENSMUST00000113406 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Myo3b-202ENSMUST00000112241 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gtf2i-216ENSMUST00000173888 2820 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Smg6P61406 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms