Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Csf1r-202ENSMUST00000115268 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ccdc163-202ENSMUST00000106462 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Cops7a-202ENSMUST00000112439 1328 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm14249-201ENSMUST00000156239 1017 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Inpp4a-211ENSMUST00000168546 2964 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm8110-202ENSMUST00000211297 1782 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Mtus2-202ENSMUST00000085554 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Rpl30-201ENSMUST00000009039 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Drd3-201ENSMUST00000023390 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm14396-201ENSMUST00000126966 548 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Nbdy-202ENSMUST00000149514 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Wfdc21-201ENSMUST00000070832 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm10308-201ENSMUST00000095183 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Eng-201ENSMUST00000009705 3422 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm26778-201ENSMUST00000181443 3805 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Nek4-201ENSMUST00000050171 2793 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Rpl27P61358 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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