Protein–RNA interactions for Protein: P56481

Cckbr, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CckbrP56481 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Olfr1258-202ENSMUST00000111516 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 AC154849.3-201ENSMUST00000223733 1660 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cbx7-203ENSMUST00000109616 2899 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ttpa-201ENSMUST00000098244 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
CckbrP56481 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm13990-201ENSMUST00000151391 2701 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ctnnal1-201ENSMUST00000045142 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Morf4l2-202ENSMUST00000080411 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 AC124397.2-201ENSMUST00000225575 2215 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Jpt2-201ENSMUST00000024981 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Ceacam18-201ENSMUST00000032663 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
CckbrP56481 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
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