Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm43372-201ENSMUST00000202662 3016 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Atg9a-205ENSMUST00000188347 4041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Zfp354b-201ENSMUST00000109124 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Col6a5-201ENSMUST00000165165 8046 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Rbm3-201ENSMUST00000040010 2792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Polr3b-201ENSMUST00000077175 4975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Lrsam1-201ENSMUST00000028132 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Syne1-201ENSMUST00000041639 6990 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm11131-201ENSMUST00000113886 3122 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Adcy6-205ENSMUST00000228566 3707 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Abcb8-203ENSMUST00000115077 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Mx2-201ENSMUST00000024112 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Rangap1-202ENSMUST00000170134 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 C1rl-201ENSMUST00000049124 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Afap1-201ENSMUST00000064571 6618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm16702-201ENSMUST00000181180 2384 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Hmgcll1-205ENSMUST00000183425 3239 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Nod1-202ENSMUST00000168172 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Itgb8-201ENSMUST00000026360 8403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Lhx9-201ENSMUST00000019374 4937 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Igf2bp1-201ENSMUST00000013559 8378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Clp1-203ENSMUST00000165219 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Cacna1c-222ENSMUST00000190285 6585 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gmppb-201ENSMUST00000047947 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Qrsl1-201ENSMUST00000020012 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Smarca1-202ENSMUST00000088973 4798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Foxred1-201ENSMUST00000043805 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm3756-201ENSMUST00000169182 1355 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Gm42853-201ENSMUST00000201273 1387 ntBASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Brca2-201ENSMUST00000044620 10724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Arel1-201ENSMUST00000043169 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Slc45a1-202ENSMUST00000117997 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Serpinb8-202ENSMUST00000112706 4581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Defa6P50704 Cacna1c-208ENSMUST00000187317 6663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms