Protein–RNA interactions for Protein: P50637

Tspo, Translocator protein, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TspoP50637 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Uba1-201ENSMUST00000001989 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Aprt-ps-201ENSMUST00000212311 505 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 BC048507-201ENSMUST00000078471 600 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
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TspoP50637 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
TspoP50637 Htr1f-201ENSMUST00000063076 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TspoP50637 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TspoP50637 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
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TspoP50637 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm26047-202ENSMUST00000198840 115 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
TspoP50637 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
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