Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ldb3-202ENSMUST00000022328 2468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm43999-201ENSMUST00000204286 2889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Pcnt-201ENSMUST00000001179 9331 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Brat1-202ENSMUST00000100505 3431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gabrb1P50571 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gabrb1P50571 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gabrb1P50571 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gabrb1P50571 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Gabrb1P50571 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Camk2g-201ENSMUST00000071816 3703 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Rasgrp4-212ENSMUST00000204194 2993 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ocstamp-201ENSMUST00000029213 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Olfr1349-207ENSMUST00000216447 2448 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Scn5a-202ENSMUST00000117911 8453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Gabrb1P50571 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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