Protein–RNA interactions for Protein: P50405

Sftpb, Pulmonary surfactant-associated protein B, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpbP50405 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm13665-201ENSMUST00000120830 528 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Mapkap1-209ENSMUST00000147337 3111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Slc25a44-202ENSMUST00000168755 3418 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Specc1l-204ENSMUST00000218766 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
SftpbP50405 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ldb2-204ENSMUST00000199256 2596 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SftpbP50405 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SftpbP50405 Slpi-202ENSMUST00000165980 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SftpbP50405 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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SftpbP50405 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Crem-233ENSMUST00000154135 2530 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Ywhaz-203ENSMUST00000110361 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
SftpbP50405 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms