Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Tesk2-201ENSMUST00000045542 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ppp6r3-203ENSMUST00000172362 4633 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm8155-201ENSMUST00000216363 1612 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Sdr9c7-201ENSMUST00000047134 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Zer1-201ENSMUST00000044751 4100 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm10782-202ENSMUST00000223775 1480 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Thoc5-201ENSMUST00000038237 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Fndc7-207ENSMUST00000180063 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm24255-201ENSMUST00000104481 128 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm16087-201ENSMUST00000124395 964 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm12395-201ENSMUST00000144765 536 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm8885-201ENSMUST00000189382 598 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Nkg7-203ENSMUST00000206741 686 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Crybg3-205ENSMUST00000172910 2870 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Slc26a11-201ENSMUST00000050880 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Msh5-202ENSMUST00000097338 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mknk2-201ENSMUST00000003433 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Rpap1-201ENSMUST00000048493 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Abo-202ENSMUST00000114045 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Trim65-202ENSMUST00000106440 4040 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Tacr1-201ENSMUST00000032122 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Oxsm-202ENSMUST00000112624 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 4933407I05Rik-204ENSMUST00000217562 1561 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Srp9P49962 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms