Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tmppe-201ENSMUST00000111820 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Olfr1171-ps1-202ENSMUST00000150178 1398 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PtpreP49446 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Glp2r-202ENSMUST00000051765 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Bpi-202ENSMUST00000109499 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm28578-201ENSMUST00000187727 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm10100-201ENSMUST00000179726 363 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 4833421G17Rik-201ENSMUST00000191704 844 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm37228-201ENSMUST00000193574 331 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Znhit6-206ENSMUST00000199033 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
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PtpreP49446 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Srp19-201ENSMUST00000072576 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fcrl1-201ENSMUST00000072480 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Neil1-202ENSMUST00000186410 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Coro6-202ENSMUST00000052515 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Cnbd1-201ENSMUST00000137780 1331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ttc29-202ENSMUST00000109902 1416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 E330011O21Rik-202ENSMUST00000209498 1403 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm13558-201ENSMUST00000140464 554 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Ddt-202ENSMUST00000172820 574 ntTSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
PtpreP49446 AC132433.1-201ENSMUST00000221553 1101 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
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