Protein–RNA interactions for Protein: P43117

Ptgfr, Prostaglandin F2-alpha receptor, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgfrP43117 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Apobec1-201ENSMUST00000112585 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ubtf-202ENSMUST00000079589 3286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 B4galt4-201ENSMUST00000023482 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Serpine1-202ENSMUST00000077523 2697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 CT010447.1-201ENSMUST00000225657 1608 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Wdr43-201ENSMUST00000047086 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Fyn-206ENSMUST00000136659 1910 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
PtgfrP43117 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
PtgfrP43117 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms