Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Psmb6-201ENSMUST00000018430 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Olfr1163-201ENSMUST00000099835 1043 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Paqr5-201ENSMUST00000034817 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Ubxn10-201ENSMUST00000105809 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rspo3-201ENSMUST00000092623 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Iqsec1-201ENSMUST00000101151 6490 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Tnfsf9P41274 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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Tnfsf9P41274 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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