Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ap4m1-201ENSMUST00000019662 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cplx3-201ENSMUST00000045068 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Trub2-210ENSMUST00000177467 744 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 H3f3a-201ENSMUST00000081026 888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Txndc5-204ENSMUST00000162075 2619 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Maob-201ENSMUST00000040820 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
TtlP38585 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Trpm1-210ENSMUST00000205731 2575 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Slc6a2-202ENSMUST00000165470 6007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Pabpc1l2a-ps-201ENSMUST00000128361 513 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 4930423D24Rik-202ENSMUST00000219785 554 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Parvg-207ENSMUST00000163667 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Ppp2r1b-202ENSMUST00000114437 3430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Sh3pxd2a-201ENSMUST00000081619 10464 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
TtlP38585 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Map7d2-202ENSMUST00000112470 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
TtlP38585 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.1 ms