Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Ly75-201ENSMUST00000028362 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Arhgef7-203ENSMUST00000098938 4628 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Kcnk18-201ENSMUST00000065204 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm6015-201ENSMUST00000217493 1586 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Cd72-204ENSMUST00000107925 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Jmjd4-201ENSMUST00000045279 4315 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Pcdhb19-201ENSMUST00000059571 7138 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Arap1-201ENSMUST00000084895 4404 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm12130-201ENSMUST00000133599 639 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Vps9d1-202ENSMUST00000118279 2696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Corin-207ENSMUST00000177290 2943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Vrtn-203ENSMUST00000167227 3440 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Kars-201ENSMUST00000034426 2008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Zfp629-203ENSMUST00000122066 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 5930430L01Rik-201ENSMUST00000145042 3994 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Dpep2-206ENSMUST00000227363 1844 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Il17rd-201ENSMUST00000035336 8280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Calhm2-201ENSMUST00000035822 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Hivep1-201ENSMUST00000060148 8753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 A130077B15Rik-201ENSMUST00000219429 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Fetub-204ENSMUST00000170805 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Vwa5b2-207ENSMUST00000159780 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Apoc1P34928 Gm28937-201ENSMUST00000185413 695 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms