Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm21319-201ENSMUST00000164517 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mafb-201ENSMUST00000099126 3363 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC122860.2-201ENSMUST00000217967 2671 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm25554-201ENSMUST00000158075 113 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hsh2d-202ENSMUST00000165324 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC153961.1-201ENSMUST00000217760 385 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tmem168-206ENSMUST00000149123 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Papss1-205ENSMUST00000199878 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 4931428F04Rik-202ENSMUST00000171788 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ssh1-202ENSMUST00000112298 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Sfxn3-201ENSMUST00000062213 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 St14-201ENSMUST00000034478 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Erich3-203ENSMUST00000189969 3460 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rbm14-202ENSMUST00000113793 3508 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm15619-201ENSMUST00000128415 1294 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm36176-201ENSMUST00000218749 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC102368.1-201ENSMUST00000227161 892 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 AC122811.1-201ENSMUST00000222257 2921 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
Nedd1P33215 Ctps2-205ENSMUST00000112302 3223 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Csnk1a1-202ENSMUST00000163205 3204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Cav2-202ENSMUST00000115459 974 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm13182-201ENSMUST00000122241 312 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Nedd1P33215 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms