Protein–RNA interactions for Protein: P31313

Hoxc11, Homeobox protein Hox-C11, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc11P31313 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Fbf1-202ENSMUST00000106435 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm43963-201ENSMUST00000203466 2488 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Lipo2-201ENSMUST00000147153 3562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Exosc10-202ENSMUST00000076022 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Oard1-202ENSMUST00000167180 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cdh15-201ENSMUST00000034443 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tceal8-204ENSMUST00000163584 2358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Kif19a-201ENSMUST00000084368 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gstm4-202ENSMUST00000106670 777 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Tmed5-203ENSMUST00000117759 482 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rpl19-201ENSMUST00000017548 751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 1110059E24Rik-208ENSMUST00000179768 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rpl19-202ENSMUST00000092425 737 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Spats2l-201ENSMUST00000163239 2313 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Srr-201ENSMUST00000065211 3699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Gm15446-201ENSMUST00000112544 2417 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Grip1-216ENSMUST00000154238 2482 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Plekhn1-204ENSMUST00000218699 3196 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
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Hoxc11P31313 Gm21103-202ENSMUST00000170923 1761 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Plxna1-201ENSMUST00000049845 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Plekhg4-203ENSMUST00000160191 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
Hoxc11P31313 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Rsph10b-203ENSMUST00000166847 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Krt33a-201ENSMUST00000018399 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
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Hoxc11P31313 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
Hoxc11P31313 Add2-204ENSMUST00000203366 3407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
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