Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sh3tc1-201ENSMUST00000070203 4549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Vmn1r45-206ENSMUST00000227977 3297 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC160410.1-201ENSMUST00000219298 1972 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmem25-202ENSMUST00000114705 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Bckdk-202ENSMUST00000124533 1792 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Satb2-205ENSMUST00000177424 4694 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mthfd1l-202ENSMUST00000117291 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pdcd11-201ENSMUST00000072141 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 4930583K01Rik-201ENSMUST00000138180 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Stim1-209ENSMUST00000211457 2183 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
VtnP29788 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
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