Protein–RNA interactions for Protein: P28867

Prkcd, Protein kinase C delta type, mousemouse

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Length 674 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcdP28867 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Adam8-202ENSMUST00000106069 3117 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Adam8-201ENSMUST00000026546 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tmem242-203ENSMUST00000188282 822 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Igkv2-116-201ENSMUST00000199327 362 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Itgal-204ENSMUST00000120857 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Csnk1g1-202ENSMUST00000117849 5173 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Nelfcd-201ENSMUST00000016397 2280 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Akap3-201ENSMUST00000095440 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm5150-201ENSMUST00000108347 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ank3-234ENSMUST00000182993 1233 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pced1a-201ENSMUST00000089581 3496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Pik3cb-201ENSMUST00000035037 6478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Wdr78-203ENSMUST00000106868 4045 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 Dld-201ENSMUST00000110857 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
PrkcdP28867 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
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