Protein–RNA interactions for Protein: P28828

Ptprm, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprmP28828 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Msrb1-202ENSMUST00000115262 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13688-201ENSMUST00000121557 608 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm12916-201ENSMUST00000139012 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm18299-201ENSMUST00000192026 636 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm9273-201ENSMUST00000200606 715 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm43122-202ENSMUST00000202259 526 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm43450-201ENSMUST00000202611 632 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC127583.1-201ENSMUST00000224351 540 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 3830406C13Rik-213ENSMUST00000225294 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Speer2-201ENSMUST00000076500 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 4930517J16Rik-201ENSMUST00000193095 1568 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Trpv4-201ENSMUST00000071968 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ppid-201ENSMUST00000029382 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rnf216-209ENSMUST00000200607 3704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Slc10a4-202ENSMUST00000201304 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Paip2-202ENSMUST00000115734 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13215-201ENSMUST00000117559 472 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 4930515B02Rik-201ENSMUST00000140588 591 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 1700026D11Rik-205ENSMUST00000151417 789 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ifna11-201ENSMUST00000170428 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Scgb1b27-202ENSMUST00000173387 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ppp1r2-ps1-201ENSMUST00000178232 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ppp1r2-ps6-201ENSMUST00000179333 621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm2328-201ENSMUST00000193525 535 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm45225-201ENSMUST00000206852 1139 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ifna1-201ENSMUST00000094972 570 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gemin8-203ENSMUST00000096252 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Chrnd-201ENSMUST00000073252 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Leprot-201ENSMUST00000030254 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Il21r-201ENSMUST00000033000 2499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm13547-202ENSMUST00000113810 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Sectm1b-206ENSMUST00000168459 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Rarres2-203ENSMUST00000204182 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm10537-201ENSMUST00000192625 1698 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 AC116596.1-201ENSMUST00000228112 1762 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Chil1-201ENSMUST00000082060 1687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtprmP28828 Igkv3-10-201ENSMUST00000103397 356 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms