Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5852-201ENSMUST00000194119 1021 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Stat5a-203ENSMUST00000107357 3605 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Uprt-201ENSMUST00000087867 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Olfr56-202ENSMUST00000102785 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tdrd3-202ENSMUST00000168275 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tbcel-206ENSMUST00000138506 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cyp2s1-202ENSMUST00000108395 3161 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm15207-201ENSMUST00000119259 442 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 1700088E04Rik-203ENSMUST00000186053 535 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm31597-201ENSMUST00000211176 515 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 AC115122.1-201ENSMUST00000224850 1040 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Phxr2-201ENSMUST00000060761 1159 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ece1-201ENSMUST00000102518 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Il33-202ENSMUST00000120388 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Cpn2-201ENSMUST00000064856 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tmem47-201ENSMUST00000026760 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Igsf3-201ENSMUST00000043983 7371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mcm2-201ENSMUST00000058011 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Nap1l3-201ENSMUST00000079490 2837 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
RxrgP28705 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
RxrgP28705 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Megf11-201ENSMUST00000068967 6680 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
RxrgP28705 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms