Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm13171-201ENSMUST00000117233 391 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 H2afb3-201ENSMUST00000122050 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm13412-201ENSMUST00000150621 677 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm5335-201ENSMUST00000182995 1000 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Timm9-210ENSMUST00000221892 734 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Rhno1-207ENSMUST00000223237 1081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm25580-201ENSMUST00000083409 327 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ppp2r2cos-201ENSMUST00000152862 1491 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Ccdc136-201ENSMUST00000096084 3826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Angpt4-201ENSMUST00000028955 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Cd79b-202ENSMUST00000167143 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Oprm1-208ENSMUST00000092734 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gm12912-201ENSMUST00000121596 1381 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Hoxd10P28359 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
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Hoxd10P28359 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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