Protein–RNA interactions for Protein: P23204

Ppara, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PparaP23204 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pram1-201ENSMUST00000052079 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Mbtps1-201ENSMUST00000081381 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Zp3-201ENSMUST00000005073 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 AC153380.1-201ENSMUST00000214959 2364 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Zbtb44-201ENSMUST00000115222 8861 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Agpat3-211ENSMUST00000166360 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Pip5k1a-204ENSMUST00000107232 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PparaP23204 Hmbox1-202ENSMUST00000067843 2931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Rps6kb1-202ENSMUST00000058286 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm5996-201ENSMUST00000211110 718 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 3300002I08Rik-201ENSMUST00000051153 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Gper1-201ENSMUST00000066211 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
PparaP23204 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms