Protein–RNA interactions for Protein: P19426

Nelfe, Negative elongation factor E, mousemouse

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Length 375 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NelfeP19426 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm7600-201ENSMUST00000209657 785 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm6145-204ENSMUST00000210902 1266 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm46336-201ENSMUST00000221894 279 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 4931406C07Rik-202ENSMUST00000178977 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
NelfeP19426 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Spr-ps1-203ENSMUST00000187705 2892 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pcdhgb7-201ENSMUST00000194928 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rab19-201ENSMUST00000031986 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Apol9a-201ENSMUST00000081776 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Abca7-201ENSMUST00000043866 6590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Polr2i-203ENSMUST00000108193 488 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 1700122E12Rik-202ENSMUST00000147538 479 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Agtpbp1-219ENSMUST00000170378 653 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
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NelfeP19426 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.63
NelfeP19426 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Zfp512-208ENSMUST00000202244 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ighv1-52-201ENSMUST00000103522 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Agtpbp1-216ENSMUST00000168821 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 1810009A15Rik-201ENSMUST00000096251 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Mdh1b-201ENSMUST00000114094 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Evi5l-208ENSMUST00000176825 3728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
NelfeP19426 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
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