Protein–RNA interactions for Protein: P18528

Ig heavy chain V region 6.96, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18528 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Madd-207ENSMUST00000111369 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Akr1c6-201ENSMUST00000021630 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Grik1-201ENSMUST00000023652 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Nacc2-202ENSMUST00000114159 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Apba2-201ENSMUST00000032732 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Glmp-201ENSMUST00000001454 1017 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Armcx6-201ENSMUST00000052431 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Icam1-201ENSMUST00000086399 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Il10ra-202ENSMUST00000176222 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Rhoj-203ENSMUST00000118966 4892 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Arpp21-217ENSMUST00000161412 1687 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 5033403F01Rik-201ENSMUST00000181376 1678 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 5033406O09Rik-201ENSMUST00000221314 1662 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Bace2-201ENSMUST00000047275 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.13□□□□□ -0.95
P18528 Triobp-203ENSMUST00000109689 7187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gtf3c1-204ENSMUST00000205659 6570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Armc8-202ENSMUST00000185524 2820 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm44008-201ENSMUST00000204345 412 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Olfr686-201ENSMUST00000050157 1018 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Slc7a7-201ENSMUST00000000984 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Cacna1s-202ENSMUST00000112068 6018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC9.12□□□□□ -0.95
P18528 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.12□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms